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2023-04-232619 次瀏覽
Quick-KO試劑盒

在現(xiàn)代生物科技領(lǐng)域,CRISPR-Cas9技術(shù)已經(jīng)成為最受歡迎的基因編輯工具之一。

這種技術(shù)可以用來(lái)研究基因功能,疾病診斷和治療等方面。其中最常用的應(yīng)用就是構(gòu)建基因敲除細(xì)胞模型。

本文將介紹CRISPR技術(shù)的基本原理和操作流程,以幫助您更好地了解和使用這種重要的基因編輯工具。

一、CRISPR技術(shù)的基礎(chǔ)原理

CRISPRClustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)技術(shù)最初是從大腸桿菌中發(fā)現(xiàn)的一種天然的細(xì)菌防御系統(tǒng),后來(lái)被發(fā)現(xiàn)可以被用于基因編輯。

CRISPR-Cas9技術(shù)基于一種叫做“RNA導(dǎo)向的機(jī)制(guide RNA, gRNA),這種機(jī)制可以讓CRISPR-Cas9系統(tǒng)選擇性地識(shí)別和切割DNA中的特定序列。這意味著我們可以使用CRISPR-Cas9來(lái)精確地編輯細(xì)胞中的基因序列,包括基因敲除、插入、替換等等。


二、操作流程

CRISPR-Cas9技術(shù)的操作流程分為四個(gè)主要步驟:設(shè)計(jì)gRNA、構(gòu)建質(zhì)粒、轉(zhuǎn)染細(xì)胞、鑒定細(xì)胞。


1.    設(shè)計(jì)gRNAgRNA是由CRISPR-Cas9系統(tǒng)識(shí)別并切割目標(biāo)DNA的關(guān)鍵部分。我們需要在目標(biāo)基因中選擇一個(gè)合適的靶點(diǎn)序列,設(shè)計(jì)gRNA來(lái)引導(dǎo)Cas9蛋白識(shí)別并切割該序列。

耐思開(kāi)發(fā)的Quick-KO?基因敲除試劑盒根據(jù)已知的人和小鼠編碼基因,采用優(yōu)化的預(yù)設(shè)計(jì)方案,相較于傳統(tǒng)方案具有更高的敲除效率。

 

2.    構(gòu)建質(zhì)粒:質(zhì)粒是攜帶CRISPR-Cas9系統(tǒng)和gRNA的載體。在構(gòu)建質(zhì)粒時(shí),我們需要將Cas9基因和gRNA序列克隆到質(zhì)粒中,并確保它們可以在細(xì)胞中穩(wěn)定表達(dá)。

耐思Quick-KO?基因敲除試劑盒中的Cas9質(zhì)粒和gRNA質(zhì)粒分別攜帶BlasticidinPuromycin/mCherry篩選標(biāo)記,方便用戶進(jìn)行陽(yáng)性細(xì)胞富集。

 

3.    轉(zhuǎn)染細(xì)胞:將質(zhì)粒轉(zhuǎn)染到目標(biāo)細(xì)胞中,讓它們表達(dá)CRISPR-Cas9系統(tǒng)并編輯目標(biāo)基因。轉(zhuǎn)染可以通過(guò)電穿孔或者化學(xué)轉(zhuǎn)染的方法進(jìn)行。

此外,針對(duì)轉(zhuǎn)染效率低的細(xì)胞,也可以選擇耐思慢病毒款的Quick-KO?基因敲除試劑盒。

 

4.鑒定細(xì)胞:最后一步是對(duì)成功轉(zhuǎn)染的細(xì)胞進(jìn)行篩選,通過(guò)PCR和測(cè)序的方法,篩選出具有目標(biāo)基因敲除的細(xì)胞。

 

三、目標(biāo)細(xì)胞類型

CRISPR技術(shù)可以用于多種細(xì)胞類型的編輯,包括哺乳動(dòng)物細(xì)胞、酵母菌、昆蟲(chóng)細(xì)胞和植物細(xì)胞等。

其中,人類細(xì)胞是最常用的細(xì)胞模型之一,可以用于疾病模型的構(gòu)建、藥物篩選和基礎(chǔ)研究等方面。

耐思Quick-KO?基因敲除試劑盒主要針對(duì)人類細(xì)胞、小鼠細(xì)胞等哺乳動(dòng)物細(xì)胞開(kāi)發(fā)。


對(duì)于不同的目標(biāo)細(xì)胞類型,我們需要根據(jù)細(xì)胞的特點(diǎn)和CRISPR技術(shù)的限制來(lái)選擇合適的CRISPR-Cas9系統(tǒng)和轉(zhuǎn)染方法。

 

四、總結(jié)

基因敲除細(xì)胞模型的構(gòu)建對(duì)于基礎(chǔ)研究和藥物研發(fā)等領(lǐng)域具有重要的意義。CRISPR技術(shù)的出現(xiàn)為基因編輯提供了一種高效、精準(zhǔn)和經(jīng)濟(jì)的方法。在使用CRISPR-Cas9技術(shù)進(jìn)行基因敲除時(shí),我們需要選擇合適的gRNA和基因遞送方法,最終獲得目標(biāo)基因敲除的細(xì)胞模型。


                                                  表1. 部分試劑盒測(cè)試細(xì)胞

細(xì)胞

種屬

組織/疾病

試劑盒方案

質(zhì)粒型

慢病毒型

22Rv1

Homo sapiens (Human)

Prostate

 

?

293T

Homo sapiens (Human)

Kidney; Embryo

?

?

4T1

Mus musculus (Mouse)

Breast; Mammary gland

 

?

A2780

Homo sapiens (Human)

Ovary

 

?

A-549

Homo sapiens (Human)

Lung

?

?

AGS

Homo sapiens (Human)

Stomach

?

 

AML12

Mus musculus (Mouse)

Liver

 

?

BEAS-2B

Homo sapiens (Human)

Bronchus; epithelium

 

?

BON-1

Homo sapiens (Human)

Pancreas

?

 

C3H10T1/2

Mus musculus (Mouse)

Embryo

 

?

CFPAC-1

Homo sapiens (Human)

Pancreas

?

?

DU145

Homo sapiens (Human)

Prostate

 

?

GIST-T1

Homo sapiens (Human)

Gastrointestinal stromal tumor

 

?

HaCaT

Homo sapiens (Human)

Back; skin; epidermis

 

?

HCC1395

Homo sapiens (Human)

Breast; Duct; Mammary gland

?

?

Hela

Homo sapiens (Human)

Uterus; Cervix

?

?

Hep3B

Homo sapiens (Human)

Pediatric hepatocellular carcinoma

?

?

Hepa 1-6

Mus musculus (Mouse)

Liver

 

?

HepG2

Homo sapiens (Human)

Liver

?

?

HL-60

Homo sapiens (Human)

Peripheral blood

?

?

HMC-1.1

Homo sapiens (Human)

Mast cell leukemia

 

?

HT-29

Homo sapiens (Human)

Colon adenocarcinoma

?

?

Huh-7

Homo sapiens (Human)

Liver, gallbladder

 

?

HUVEC

Homo sapiens (Human)

Umbilical vein

 

?

IMG

Mus musculus (Mouse)

Brain

 

?

IPEC-J2

Sus scrofa (Pig)

Small intestine; jejunum

 

?

Jurkat

Homo sapiens (Human)

Peripheral blood

?

?

K-562

Homo sapiens (Human)

Bone; Marrow

?

?

KM12-SM

Homo sapiens (Human)

Colon carcinoma

 

?

LoVo

Homo sapiens (Human)

Colon adenocarcinoma

 

?

MDA-MB-231

Homo sapiens (Human)

Breast adenocarcinoma

 

?

MEG-01

Homo sapiens (Human)

Bone marrow

 

?

mIMCD-3

Mus musculus (Mouse)

Kidney; inner medullary collecting duct

?

?

MTEC1

Mus musculus (Mouse)

Thymus

 

?

MCF-7

Homo sapiens (Human)

Invasive breast carcinoma

 

?

NIH 3T3

Mus musculus (Mouse)

Whole embryo

 

?

PANC-1

Homo sapiens (Human)

Pancreas; Duct

 

?

PC-3

Homo sapiens (Human)

Prostate

 

?

QGP-1

Homo sapiens (Human)

Pancreas; islets of Langerhans

?

?

SGC-7901

Homo sapiens (Human)

Uterus; cervix

 

?

SH-SY5Y

Homo sapiens (Human)

Neuroblastoma

?

?

SK-HEP-1

Homo sapiens (Human)

Liver; Ascites

?

?

SNU-1

Homo sapiens (Human)

Stomach

?

?

SW480

Homo sapiens (Human)

Large intestine; Colon

 

?

T-47D

Homo sapiens (Human)

Breast; Mammary gland

 

?

THP-1

Homo sapiens (Human)

Peripheral blood

 

?

U-87MG

Homo sapiens (Human)

Brain

 

?

UM-UC-3

Homo sapiens (Human)

Urinary bladder

 

?

WS1

Homo sapiens (Human)

Skin

?

?

CT26

Mus musculus (Mouse)

Colon

 

?

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